Eine Zusammenfassung laut der unten aufgeführten Untersuchungen:

• Es wird vom Hersteller die Untersuchung des Protokolls (Reverse Engineering) absichtlich erschwert (Verschlüsselung)
• Auch Programm Skype ist bewusst verschlüsselt, um die Untersuchung zu erschweren (Binary Protection)
• Das Protokoll ist proprietär und nicht offengelegt
• Es ist somit nicht nachvollziehbar, was Skype im Hintergund treibt (vorsätzliche Entstellung des Verkehrs -> Jam traffic)
• Der eigene Rechner dient als Server (Proxy) für andere (unbekannte) Nutzer. Umgekehrt fließen u.U. eigene Daten über Rechner Fremder
• Das Programm Bohrt eigenständig Löcher durch die Firewall (weshalb es auch so einfach zu installieren ist)
• Verschlüsselung im Programm nicht zugunsten der Privatsphäre der Anwender
• Abhören der Kommunikation durch Skype und durch andere “Dr. Evils” möglich
• Es gibt bekannte Sicherheitslücken (Stand März 2006), die Skype zum Absturz bringen können und dem Angreifer Zugriff auf das System gewähren (Exploits)

Siehe auch:

• Silver Needle in the Skype, Studie über das Netzprotokoll von Skype, European Aeronautic Defence And Space Command, P.Biondi und F. Desclaux
• Social Software mit dunkler Seite (besonders Abschnitt The Dark Side of the Skype-Hype)
• An Analysis of the Skype Peer-to-Peer Internet Telephony Protocol, University of Columbia (2004), S.A. Baset und H. Schulzrinne
• Skype unter die Lupe genommen, Heise News
• Skype liest BIOS aus, Heise News